Αρχείο χημικών πληροφοριών που δημιουργούνται από το ChemDraw, ένα πρόγραμμα επεξεργασίας ατόμων για πλατφόρμες Windows και Macintosh. Αποθηκεύει μοριακά δεδομένα σε δυαδική μορφή με ετικέτες (tag). Χρησιμοποιείται για την αποθήκευση ακριβών χημικών σχεδίων.
Τα αρχεία CDX αποθηκεύουν πληροφορίες όπως τα άτομα, τους δεσμούς, τα επιμέρους τμήματα, τα βέλη, και το κείμενο. Η μορφή CDX είναι η μητρική μορφή που χρησιμοποιείται από το ChemDraw. Μια άλλη μορφή που ονομάζεται CDXML (αρχεία .CDXML) χρησιμοποιείται για την εξαγωγή και ανταλλαγή δεδομένων CDX σε μορφή XML.